严格的管理
(1)扩增产物分析区可能会用到某些可致基因突变和有毒物质，琼中PCR实验室净化，应特别注意实验人员的安全防护。
(2)尽量减少在实验区内不必要的走动以减少交叉污染的可能性。
完备的实验室配套设施
完备的实验室配套设施是保证实验工作的必要条件，PCR实验室净化设计，应根据各个实验室实验内容的不同配备相应的设备和仪器，如超净工作台、离心机、加样器等。
这个区域专门用作样品的准备，PCR实验室净化施工，在制备和操作用于核酸提取的试剂时应该采取预防措施：⑴PCR产物和带有要扩增序列的DNA克隆不能在这个房间操作。⑵组织培养物、组织标本和血清样品都带进样品准备间处理，以根据应用的需要提取DNA或RNA。⑶用于样品处理的工具不能被用作普通分子克隆的工具，也不能用作操作靶序列。⑷DNA样品应该用有专门的防护或正压活塞式移液管操作，以防止在吸取样品时有气溶胶遗留。⑸大体积样品应该用单独包装的无菌一次性移液管吸取。⑹管子打开前都要简短离心以减少气溶胶的产生，PCR实验室净化规范，而且管子不能用力崩开，这样会产生气溶胶。⑺任何时候都应该穿实验服和带手套，手套要经常更换，尤其在抽提过程中每一步之间都要更换。实验服要专门用于样品准备间，经常清洗。
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