手术室的污染源主要有来自外部和来自手术室内部的两部分：
1 、来自外部的污染源主要是送到手术室的新风。具统计室外空气中的细菌和 微生物的数量大约为1-1000个/英尺3，层流手术室净化原理，而且这些细菌和微生物大多都附着在灰尘粒子上，不同地区的污染程度也不相同。
2、来自洁净手术室内部的污染源，主要是手术的医生和护士、手术的患者以及手术过程的产菌产尘。
在一间没有任何障碍物的空房间，单向流用比前面提到的低得多的风速，喀什层流手术室净化，就可以很快将污染物清除。但在一个操作间，机器以及机器周围走动的人员，会对气流形成障碍。障碍物可以使单向流变成紊流，从而在障碍物周围形成气流团。人员的活动也可以使单向流变成紊流。在这些紊流中，层流手术室净化，由于风速较低，空气稀释程度较小，从而使得污染浓度较高。
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