按手术有菌或无菌的程度，手术间可划分成以下5类：(1)Ⅰ类手术间：即无菌净化手术间，主要接受颅脑、心脏、脏器移植等手术。(2)Ⅱ类手术间：即无菌手术间，医院无菌手术室，主要接受脾切除手术、闭合性骨折切开复位术、眼内手术、甲状腺切除术等无菌手术。(3)Ⅲ类手术间：既有菌手术间，专业制作医院无菌手术室，接受胃、胆囊、肝、阑尾、肾、肺等部位的手术。(4)Ⅳ类手术间：即感染手术间，主要接受阑尾穿孔腹膜炎手术、结核性脓肿、脓肿切开引流等手术。(5)Ⅴ类手术间：即特殊感染手术间，重庆无菌手术室，主要接受绿脓杆菌、气性坏疽杆菌、破伤风杆菌等感染的手术。按不同专科，手术间又可分为普外、骨科、妇产科、脑外科、心胸外科、泌尿外科。烧伤科、五官科等手术间。由于各专科的手术往往需要配置专门的设备及器械，因此，专科手术的手术间宜相对固定。
例如上海金田科瑞洁净科技有限公司、江苏苏净集团、上海三现净化装饰工程有限公司、姑苏净化科技有限公司、中国电子系统工程第二建设有限公司、上海奇士企业发展有限公司等。
为保证洁净室及相关环境达到受控标准，对其基本的空气热湿处理设备、空气净化设备、空气动力设备、空气分布系统、冷热源设备、高效送风口、净化工作台、洁净单元、风淋室、传递窗及微环境以及洁净服、手套、口罩、清洁用品等也有特殊要求
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