试剂准备区仪器设备主要有冰箱、超净台、加样器、混匀器、天平和离心机等，加样器、天平除了要专用外，实验室净化改造工程，还应有定期校准。试剂分装应在超净台中进行扩增反应混合液应使用分子生物学级的，实验室净化标准，试剂制备好后应有质检：一是否有污染、二是检测试剂的扩增效果。
标本制备区仪器设备主要有生物安全柜、加样器、离心机、温育仪、混匀器等
1、样品准备和RNA-PCR RNA-PCR的额外步骤需要额外的样品操作，这样增加了样品之间污染的机会。为了避免这一问题，反转录一步可以在样品准备区进行。在RNA-PCR中应用UNG以防止污染的方法也有报道。
2、后PCR区PCR完成以后，实验室净化，需要分析样品并解释数据，应该留出一个专门用于反应后处理样品的地方。后PCR活动中使用的所用试剂、一次性耗材和仪器都必须是专门用于这一目的，决不能把实验室这一区域的试剂或仪器用于任何前PCR活动
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