无菌室应设有无菌操作间和缓冲间，无菌操作间洁净度应达到10000级，室内温度保持在20-24℃，湿度保持在45-60%。超净台洁净度应达到100级。
1、无菌室应保持清洁，严禁堆放杂物，以防污染。
2、严防一切灭菌器材和培养基污染，已污染者应停止使用。
3、无菌室应备有工作浓度的消毒液，如5%的甲酚溶液，70%的酒精，0.1%的新洁尔灭溶液，等等。
4、无菌室应定期用适宜的消毒液灭菌清洁，以保证无菌室的洁净度符合要求。
5、需要带入无菌室使用的仪器，器械，中药制剂无菌车间，平皿等一切物品，医药包生产无菌车间，均应包扎严密，枣庄无菌车间，并应经过适宜的方法灭菌。
医疗器械洁净车间的设计中，通常采用隔断方式将空间分成若干个小洁净区，一般这些房间设置是密闭状态，这样做是为了控制外界的污染。但是较多洁净室会有热湿无法排出的情况，这时会采用排风系统进行处理。
1.工业净化工程生产中由于高温的设备会不断排出热气，热气体排风系统可对其进行热回收处理。当有便或是排气量小时采用隔热措施。
2.有些产品在生产过程中会排出酸或碱性气体，采用酸、碱气体排风系统设置湿式洗气吸收塔进行处理。
3.一般排风系统将生产过程中排出的一般废气直接排入大气。
4.生产过程中有时会用到各类有机物，这时会产生有机物质的气体，采用有机气体排风系统对其进行处理。
5.净化车间内，不同产品在生产过程中会排出不同浓度粉尘物质，采用含粉尘的排风系统对排出的气体进行过滤处理。
6.工业净化工程对特殊成份的产品进行生产时，会产生特殊气体，药包材生产无菌车间，如毒性、腐蚀性等，采用特殊气体排气系统对排出气体进行处理，达标后排入洁净室大气中。
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